Български
English
За проекта
Чрез провеждането на in silico (компютъризирани) експерименти целим:
- моделиране и оптимизиране структурата на мю-, делта- и капа- опиоидни рецептори, невротензинови и канабиноидни рецептори;
- определяне структурата на лиганд-рецепторния комплекс и минималната свободна енергия на свързване при известни структури на рецептор и лиганд, и изследване начинът на свързване с цел предлагане на модификации в лигандите;
- предсказване на биологична активност;
- разработване на математически модел за предсказване на биологична активност чрез използването на резултатите от молекулния докинг на новите лиганди и резултати от in vitro тестове;
- изследване приложимостта на облачни структури и сървърна виртуализация при задачи за нагъване на протеини, докинг и определяне на биологична активност.
Методи и модели за постигане на целите:
- "хидрофобно-хидрофилен" модел;
- метода за хомоложно моделиране;
- решаване на задачата за нагъване на протеини чрез използване на следните алгоритми: евристични, оптимизационно-комбинаторни и апроксимационни;
- определяне начина на свързване на лиганда и рецептора чрез прилагане геометрични и енергетични методи;
- ще се приложат лиганд-базирани и структурно-базирани подходи, в това число: анализ на молекулни полета, хомоложно моделиране на протеини, докинг и виртуален скрининг на биоактивни съединения, идентификация и анализ на лиганд-белтъчни взаимодействия за 3D структурата на таргетната биомакромолекула.
Очаквани резултати:
- моделиране и оптимизиране на триизмерната структура на изследваните рецептори – опиоидни, невротензинови и канабиноидни;
- разработване на математически модел, описващ връзката между докинг резултатите и параметрите с конкретно биологично значение от in vitro изследвания, за да се определи биологичната активност на съединенията;
- извеждане на количествена зависимост между биологичната активност на серия от съединения и техните физико-химични свойства.
| За проекта |
|---|
| За биоинформатиката |
| Цели и задачи |